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Sunday, June 11, 2006

Bioinformatics

Hasta ahora nadie se ha interesado acerca de lo que estoy haciendo en Boston. Vamos, del trabajo y eso.
Bueno, pues como nadie lo pregunta y me consideraba obligado a que apareciese (tarde o temprano) este tipo de información (más que nada, para justificar mi estancia por estos lares durante 6 meses), ahí va el rollo:

Estoy trabajando con herramientas de Bioinformática parte de la información acerca de la expresión de genes que hay en una base de datos pública. Allí estan recogidos los datos crudos obtenidos mediante microarrays (chips de ADN) de expresión de ciento de miles de genes de humanos, ratones y ratas con o sin obesidad y que han sido sometidos a varios tipos de experimentos con dietas ricas o pobres en diferentes tipos de grasas. La idea es obtener perfiles de expresión (up, flat, down-regulation genes), luego relizar SOM (self-organizing maps) para poder ir a las regiones de los cromosomas y "pescar" nuevos genes (no descubiertos aún) que puedan estar relacionados con el metabolismo de las grasas y la obesidad, así como realizar una búsqueda de TFBS (Transcription Factor Binding Sites) para ver cómo están regulada dicha expresión.

Bueno, ahí queda eso. A mi me gusta un montón. Es el futuro. Unos han hecho los experimentos (wet laboratory) y otros sacamos partido a esa información (dry laboratory).

Es la Bioinformática, nos alimentamos de los datos de los demás. ;-)

1 Comments:

Blogger Juan Ruano said...

Gracias a la parejita!

Así me gusta, animando el Blog. Nada, cuando queráis, el viaje ida y vuelta son unos 1000-1200 eu por cabeza. Boston es muy bonito. Además, Nueva York queda a unas 4h en bus (30$=25eu), que siempre merece la pena.

Un abrazo a los 3.

4:25 PM  

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